基于高通量测序的热疗对鼻咽癌CNE2细胞转录组基因表达的影响

摘要：目的:探讨热疗对鼻咽癌CNE2细胞转录组基因表达的影响,并对与鼻咽癌相关的差异表达基因进行初步的筛选,为热疗治疗鼻咽癌的机制研究提供依据.方法:将鼻咽癌CNE2细胞分为空白组和实验组.实验组CNE2细胞恒温水浴42℃,1 h后,继续培养24 h.提取总RNA并构建文库,用高通量Ilumina HiSeqTM2500测序平台进行样本的转录组测序,利用IPA软件进行数据分析,对转录组测序结果进行参考基因组注释、比对,并使用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析方法对差异表达基因进行功能富集分析.结果:利用高通量转录组测序技术得到3184个差异表达基因,其中2712个上调差异表达基因,472个下调差异表达基因.差异基因涉及92条信号通路和476个上游调控分子.上游调控分子的类型包括了生长因子、转录调节因子、细胞因子、跨膜受体、激酶、肽酶、细胞核受体、微小核糖核酸、生长因子二聚体结构等.GO和KEGG富集分析结果显示差异表达基因显著富集细胞生长、细胞外基质的组成、胞外结构组织、迁移等肿瘤相关生物进程,并参与多条与癌症相关的信号通路.结论:综上结果说明热疗对鼻咽癌CNE2细胞所产生的影响不是单纯的抑制和杀伤作用,同时也刺激CNE2细胞产生了内部应力来抵抗外部因素对自身的打击.这种应激作用涉及了许多基因和细胞信号通路,终作用就是促进自身肿瘤细胞的增殖、转移、抑制自身细胞的凋亡并促进肿瘤血管的形成.本次测序所筛选的差异基因和信号通路为热疗治疗鼻咽癌的作用机制研究提供一定的科研基础和研究思路.