期刊简介
《饮食保健》(半月刊)由内蒙古大学主管主办，中国医促会协办的专业性国家级医学学术期刊、是中国医促会会刊。
《饮食保健》服务于医学创新研究，以医疗事业改革和广大医疗工作者探究学习，增强医德，提升医术为主旨，努力体现专业性，学术性，权威性，贴近实际，追求实用。本刊长期面向全国征集医学学术论文,在本刊发表的论文可获得国家级继续教育学分。
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- 杂志名称：饮食保健杂志
- 主管单位：内蒙古大学
- 主办单位：内蒙古大学出版社
- 国际刊号：2095-8439
- 国内刊号：15-1371/R
- 出版周期：半月刊
期刊荣誉：中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录：维普收录(中)
基于GEO数据库的前列腺癌发生相关基因筛选
林睿；张鸿翔；蒙清贵；张庆云；易贤林；程继文
关键词：前列腺癌, GEO数据库, 高通量芯片, R语言, limma程序
摘要：目的:探索前列腺癌发生的关键基因,为前列腺癌的治疗寻找新的靶点.材料方法:根据标准流程提取GEO数据库中GSE55495芯片数据:13例前列腺癌8例正常前列腺癌进行收集处理、整合,分析.采用计算机R语言编程分析并绘制芯片热图(pheatmap)、火山图(Volcano Plot)显示差异基因,并提取其中的关键差异基因,绘制蛋白-蛋白相互作用图.结果:测样本中共存在328个表达差异基因,其中上调的基因有233个,下调的基因有95个.通过STRING在线工具对差异基因及其编码的蛋白分析,结果发现差异蛋白及编码其的基因主要集中在RND3、CAV2、CAV1、CALM1、FLNA等22个基因上.再通过热图及火山图分析进一步缩小关键基因的范围,并对关键基因进行文献挖掘发现,FLNA等基因可能与前列腺癌的发生密切相关.结论:通过GEO芯片数据再分析,缩小探索前列腺癌发生相关基因的范围,其中显示FLNA、DLX2等基因与前列腺癌的发生关系密切,为深入研究前列腺癌的发病机制提供新的潜在基因位点.
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